宋初曾下诏全国各县上报僧尼之数。据《宋朝事实类苑·祖宗圣训》记，宋太宗曰：“古者，一夫耕，三人食，尚有受其馁者，今殆二十人矣。”这就是说，以前一人种田，仅可勉强养活3人，如今一人种田却要养活20人。原来五代以后，为逃避租赋、徭役，大量家人为僧尼。如宋太宗所云：“东南之俗，连村跨邑去为僧者，盖慵稼穑而避徭役耳。”其时，泉州知州上奏朝廷，太宗去：“泉州奏，未剃僧尼系籍者四千余人，其已剃者数万人，尤可惊骇。”这表明宋初泉州逃赋役而入佛门的百姓之众，成为社会经济的严重问题。于是宋朝统治者对佛教采取经济上限制，政治上利用的政策。宋代兴起的程、朱理学在批判佛教的同时，又吸收佛教那些有利于封建统治的部分教义，提出儒、道、释合一的主张。宋朝严格管理佛教，从建寺院到剃度僧尼，都得经政府有关部门批准，实行度牒制度，限制寺院财产。泉州的佛教失去唐、五代时期发展的势头。
但是宋代泉州的社会经济繁荣，特别是泉州的海外贸易繁盛，佛教寺院积聚了巨大的财富，僧人和善信兴起了历史上没有过的大规模的修寺、建塔、造桥工程。唐、五代遗留下来的规模较大的佛寺得到重修，也新建不少的寺庙，如崇福寺、南天寺、法石寺和小雪峰寺，在泉州开元寺建甘露戒坛等。而泉州的地方官大都延请高僧，改建院堂，改变了对佛教寺院的管理方式。如熙宁年间（1068——1077年），守陈枢改粥院为禅院，延请本观禅师主法华院、大中寺、崇福寺和水陆寺。元丰年间（1078——1085年），知州乔郎中，以泉州开元寺为禅林，延请僧子琦住持罗山院、承天寺。又如僧宗达，居泉州开元寺之普贤院，知州德秀延请其主崇福寺。
宋代泉州开元寺东西二塔的建筑，既反映了社会经济的发展，也反映了泉州佛教寺院积聚的财富。据乾隆《泉州府志·坛庙寺观“转引明朝蒋德璟《双塔记略》云，开元寺东镇国塔，唐文禅师以本造，凡九级，六年方成，赐名镇国，唐咸通中（860——873年），以佛舍利镇塔中。“宋天禧中（1017——1021年），改为十三级”。“绍兴乙亥（绍兴二十五年，1155年），灾。淳熙丙年（淳熙十三年，1186年）僧了性重建。宝庆丁亥（宝庆三年，1227年）复灾，僧守淳易以砖，凡七级。嘉熙戊戌（嘉熙二年，1238年），僧本洪始易以石，仅一级而止。僧法权继之，至第四级。晋江人天竺院讲主（天赐）作第五级及合尖，凡十年始成。”塔高48.24米。
泉州开元寺西仁寿塔，据《双塔记》云，建于梁贞明二年（916年），号无量寿塔。宋政和甲午（政和四年，1114年），据传有青黄光起塔中，光束直冲云霄，不久变成五色光彩，天明乃灭，因此赐名仁寿。绍兴乙亥（绍兴二十五年，1155年）灾，淳熙年间，僧了性再造，复灾。僧守淳易以砖。绍定元年（1228年），僧自证始易以石。嘉熙元年（1237年）竣工，先镇国塔十年而成。塔高44.06米。
此外，还有石狮的万寿塔，又名“关锁塔”，俗称“姑嫂塔”，在宝盖山上。据《泉州府志·山川》记，关锁，水口镇塔也。登之可望商舶往来，宋绍兴中（1131——1162年），僧介殊建。故万寿塔即是风水塔，也是出入泉州湾舶的航标灯塔。塔高21米。
泉州开元寺拜庭有两座波罗门金涂式石塔。通高5.48米，每面刻四尊佛像，塔身四面刻圆拱龛，龛内浮雕故事图。塔顶四个转角雕刻带翅膀的怪兽，颇似唐墓出土的愧头俑。塔顶为方形石盖，四面刻佛的称谓，顶为复莲盆及多层相轮尖顶。塔顶四个转角坚起的石雕山花、蕉叶。卷云、人物故事画。左边一座塔的须弥座上刻：“右南厢梁安家室柳三娘，舍钱造宝塔二座，同祈平安。绍兴乙丑（绍兴十五年，1145年）七月题。王思问舍钱三十贯，乙酉重修。”
1982年8月，台风刮倒拜庭巨榕，榕树压倒石塔，塔中清理出五代时时泉州刺史王继勋等善信捐资雕刻的佛顶尊胜陀罗经幢。又清理出银质鎏金观音像，背面刻“泉州右南厢宣明坊女弟子柳三娘，与夫主梁安共舍宝塔一座，永充供奉，合家人口等增延福寿。时绍兴十五年六月日”。从铭方舍钱造塔的目的是“同祈平安”和“合家人口等增福延寿”，这表明了宋代泉州佛教的进一步世俗化。
